單細(xì)胞全轉(zhuǎn)錄組測序新技術(shù)邁入新階段
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2014年4月29日，生物動(dòng)態(tài)光學(xué)成像中心黃巖誼、湯富酬課題組在《美國科學(xué)院院刊》(PNAS)上發(fā)表題為Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing的論文。該研究利用微流控芯片技術(shù)實(shí)現(xiàn)了高質(zhì)量單細(xì)胞的全轉(zhuǎn)錄組測序樣品準(zhǔn)備，全面提高了單細(xì)胞全轉(zhuǎn)錄組分析的準(zhǔn)確性和可靠性。
單細(xì)胞測序利用新一代的測序技術(shù)來分析單個(gè)細(xì)胞內(nèi)的基因信息，成為解讀單細(xì)胞的最佳工具。單細(xì)胞全轉(zhuǎn)錄組測序是單細(xì)胞高通量測序需求量最大的應(yīng)用，它所測定的是單個(gè)細(xì)胞內(nèi)所有基因的表達(dá)量，同時(shí)還可以測定除了mRNA分子外，其他長非編碼rna(lncRNA) 以及小RNA的含量，定量獲取單個(gè)細(xì)胞完整的表達(dá)譜。目前采用的新一代測序技術(shù)中，絕大多數(shù)方法都需要特定的前處理過程，制備“測序文庫”。而針對單細(xì)胞 樣品，已有的方法均存在很多缺陷，導(dǎo)致檢測靈敏度不高、基因表達(dá)信息丟失嚴(yán)重、技術(shù)噪音高、操作失誤率高、重復(fù)性差。
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| 通過多個(gè)細(xì)胞較低深度的轉(zhuǎn)錄組測序，可以獲取比同等成本下單個(gè)細(xì)胞高深度測序更 重要的細(xì)胞異質(zhì)性信息，而更好地展現(xiàn)生物體系的復(fù)雜性、隨機(jī)性和動(dòng)態(tài)過程。而通過微流控芯片上的精確細(xì)胞操控和主動(dòng)俘獲過程，還可以擺脫其他類似方法中隨 機(jī)俘獲的局限性，實(shí)現(xiàn)對極其少量細(xì)胞的完全俘獲和反應(yīng)前的表型觀察，以更好地理解和驗(yàn)證單個(gè)細(xì)胞的異質(zhì)性。與已有的技術(shù)相比，這一工作展示了目前最好的單 細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序檢測靈敏度和平行性。 |