表觀遺傳研究的新蛋白微陣列技術(shù)
生物分子間相互作用,尤其是基于動態(tài)修飾的生物分子間識別互作,是生命活動在分子層面的具體體現(xiàn),也是生命調(diào)控的重要生化分子基礎(chǔ)。因此,發(fā)現(xiàn)和鑒定生物分子互作對是了解信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、基因調(diào)控、以及功能復(fù)合物形成的基礎(chǔ)和前提。
清華大學(xué)醫(yī)學(xué)院,美國德州大學(xué)MD安德森癌癥中心等處的研究人員通過構(gòu)建組蛋白閱讀器結(jié)構(gòu)域蛋白芯片,并結(jié)合基于結(jié)構(gòu)的構(gòu)效關(guān)系演化,開發(fā)出專門針對Spindlin1的活性小分子抑制劑,為今后模式結(jié)構(gòu)域靶向的藥物篩選與開發(fā)提供了一種新技術(shù)模式。
這一研究成果公布在Nature Chemical Biology雜志上,文章通訊作者分別為清華大學(xué)生科院李海濤教授,MD安德森癌癥中心Mark Bedford教授、意大利薩萊諾大學(xué)Gianluca Sbardella教授。文章第一作者之一為海濤實驗室博士后蘇曉楠。
李海濤教授長期致力于新型表觀遺傳“修飾-識別因子”互作對的發(fā)現(xiàn)和功能鑒定,先后發(fā)現(xiàn)并闡明了包括YEATS、PHD鋅指等在內(nèi)的一系列“閱讀器”(reader)結(jié)構(gòu)域識別組蛋白?;⒓谆刃揎椀姆肿踊A(chǔ)和調(diào)控機制。
比如其研究組曾發(fā)現(xiàn)了一種新型組蛋白乙?;喿x器(reader)-YEATS結(jié)構(gòu)域,揭開了組蛋白乙?;D(zhuǎn)錄調(diào)控研究新篇章.這是繼1999年把溴域定義為組蛋白乙?;喿x器后,組蛋白乙?;R別調(diào)控領(lǐng)域的一個重要突破,開啟了組蛋白乙?;D(zhuǎn)錄調(diào)控研究新方向。李海濤:把強大的工具做成有趣的科學(xué)
近期這一研究組也在PNAS上發(fā)文(Kinetic and high-throughput profiling of epigenetic interactions by 3D-carbene chip-based surface plasmon resonance imaging technology),報道了基于三維表面和卡賓化學(xué)的表面等離子體共振成像(SPRi)微陣列技術(shù)在檢測生物分子互作尤其是修飾依賴互作中的應(yīng)用。
這些研究都是李海濤研究組嘗試在表觀遺傳互作工具方面的開發(fā),突出了高通量“l(fā)ab-on-chip”微陣列技術(shù)在表觀遺傳學(xué)研究的重要推動作用。
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