微流控技術(shù)在法醫(yī)DNA快速檢驗(yàn)方面的應(yīng)用
微流控芯片技術(shù)因其微型化、自動(dòng)化、高通量、集成化、快速等優(yōu)勢(shì)使得實(shí)驗(yàn)室研究產(chǎn)生革命性的變化,并在生物化學(xué)、醫(yī)學(xué)等諸多領(lǐng)域得到廣泛應(yīng)用,但目前還沒(méi)有基于微流控芯片技術(shù)的國(guó)產(chǎn)全集成自動(dòng)化DNA分析儀。
此篇文章為大家講解微流控技術(shù)在法醫(yī)DNA快速檢測(cè)方面的研究進(jìn)展,同時(shí)介紹國(guó)內(nèi)外全集成式DNA分析的研究狀況。未來(lái),以微流控芯片為主導(dǎo)的全自動(dòng)、便攜式、集成式、集成化的DNA分析系統(tǒng),將使得法醫(yī)DNA檢驗(yàn)從實(shí)驗(yàn)室走進(jìn)案件現(xiàn)場(chǎng)甚至日常生活,實(shí)現(xiàn)真正快速即使檢驗(yàn)。
傳統(tǒng)的法醫(yī)DNA檢測(cè)過(guò)程包括生物檢才提取、DNA提取和定量、PCR復(fù)合擴(kuò)增、毛細(xì)管電泳等,整個(gè)過(guò)程大約需8~10h,不僅耗時(shí)耗力,需購(gòu)置特定的實(shí)驗(yàn)儀器,大多步驟以及反應(yīng)之間的轉(zhuǎn)換需手工操作,而且需要專業(yè)人員進(jìn)行操作。從根本上解決日益緊迫的DNA物證檢驗(yàn)量、集成化和自動(dòng)化是必然選擇。從20世紀(jì)90年代逐漸興起的微流控芯片技術(shù)具有體積小、樣本和試劑消耗少、分析成本低、分析速度快,易于實(shí)現(xiàn)操作流程集成化和自動(dòng)化等諸多優(yōu)勢(shì),為實(shí)現(xiàn)法醫(yī)DNA快速分析開(kāi)辟了一條新途徑。
諸多學(xué)者從微流控技術(shù)角度出發(fā),對(duì)涉及DNA快速檢測(cè),包括芯片DNA提取、芯片PCR擴(kuò)增、毛細(xì)管芯片電泳及集成式芯片等各方面進(jìn)行了研究。
1、芯片DNA提取技術(shù)
芯片DNA提取技術(shù)方面,傳統(tǒng)的DNA提取方法需要多次震蕩、離心、轉(zhuǎn)移等,操作費(fèi)時(shí),不易整合到芯片上,更不適合DNA的快速檢驗(yàn)。國(guó)內(nèi),研究人員應(yīng)用PMMA芯片制作了非填充式DNA提取芯片,從血中提取DNA且能夠滿足后續(xù)PCR的需要。后來(lái)國(guó)內(nèi)研究人員研究了PDMS芯片DNA微分析系統(tǒng),將磁珠固相提取技術(shù)與微流控芯片相結(jié)合,成功完成大腸桿菌熱裂解、DNA提取至PCR擴(kuò)增的全過(guò)程,為單芯片上集成多功能提供了可能。更有研究者開(kāi)發(fā)了其他在芯片上的提取方法,例如基于pH誘導(dǎo)的靜電吸附DNA提取、基于UV活化的聚碳酸酯表面的DNA提取、基于納米多孔濾膜的DNA提取。
2、芯片PCR擴(kuò)增技術(shù)
PCR芯片根據(jù)其液體流動(dòng)方式可分為微反應(yīng)腔式PCR芯片和連續(xù)流動(dòng)式PCR芯片。其中,微反應(yīng)腔PCR芯片實(shí)際上是傳統(tǒng)PCR的微型化,將反應(yīng)混合物固定在微反應(yīng)池內(nèi),通過(guò)外部對(duì)其不斷加熱與制冷來(lái)實(shí)現(xiàn)溫度循環(huán),該種芯片具有體積小,結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,易于制作成一次性、集成度高、易于整合其他功能芯片的特點(diǎn)。連續(xù)流動(dòng)式PCR芯片,是將反應(yīng)混合物于3個(gè)恒溫區(qū)內(nèi)連續(xù)流動(dòng),沒(méi)流過(guò)3個(gè)溫區(qū)即完成一次擴(kuò)增,具有反應(yīng)速度快、擴(kuò)增時(shí)間短的特點(diǎn)。
后來(lái)研究人員為了實(shí)現(xiàn)多個(gè)樣本的同時(shí)擴(kuò)增,研究人員在設(shè)計(jì)的PMMA多通道擴(kuò)增芯片上,利用快速DNA酶和紅外擴(kuò)增系統(tǒng),39min就能夠同時(shí)完成最多個(gè)樣本的STR擴(kuò)增,不僅提高了檢測(cè)通量,而且縮短了DNA分型時(shí)間,同時(shí)降低了每個(gè)樣本的檢測(cè)成本,更體現(xiàn)出微流控技術(shù)在法醫(yī)DNA快速分析的優(yōu)勢(shì)。
3、毛細(xì)管芯片電泳技術(shù)
毛細(xì)管芯片電泳技術(shù),早期主要集中在芯片毛細(xì)管電泳的進(jìn)樣方式、流體控制及影響分離柱效的因素等基礎(chǔ)性研究工作中。后來(lái),Mathies實(shí)驗(yàn)室搭建了具有4通道的微陣列芯片電泳裝置,在有效分離長(zhǎng)度為10cm的芯片上實(shí)現(xiàn)9個(gè)STR基因座的分離,該裝置的檢測(cè)限為25個(gè)拷貝。2010年,同一實(shí)驗(yàn)室又開(kāi)發(fā)出集成PCR擴(kuò)增的便攜式共聚焦熒火掃描的多通道毛細(xì)管電泳檢測(cè)平臺(tái),能夠在分離長(zhǎng)度為7cm的芯片上同時(shí)完成96個(gè)樣本的檢測(cè),檢出限為20pmol/L。
目前,芯片毛細(xì)管電泳已從實(shí)驗(yàn)研究階段逐步向產(chǎn)業(yè)化方向發(fā)展。已能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)DNA、RNA、蛋白質(zhì)等高通量的分離分析。
4、集成式芯片
在集成式芯片研究方面,盡管將法醫(yī)DNA分析全流完成集成于一體存在很大挑戰(zhàn),但是一些研究者已嘗試?yán)梦⒘骺叵到y(tǒng)將各種步驟與芯片毛細(xì)管電泳相結(jié)合。
2014年,Delphine等在前期工作基礎(chǔ)上,成功研發(fā)出用于法醫(yī)個(gè)體識(shí)別的全集成式的微流控芯片,該芯片由塑料制成,包括基因分型全過(guò)程:一種獨(dú)特酶反應(yīng)液的DNA制備、紅外非接觸式PCR擴(kuò)增及高分辨率的電泳分離,并證明了2h能夠從口腔拭子和FTA卡樣本得到18個(gè)STR基因座分型,且檢測(cè)結(jié)果和傳統(tǒng)方法完全一致。
近幾年微流控芯片技術(shù)在DNA快速檢測(cè)方面取得了突破性進(jìn)展,引起產(chǎn)業(yè)界的很大關(guān)注,國(guó)外推出的3款商業(yè)化的快速檢測(cè)儀器,以滿足法醫(yī)DNA現(xiàn)場(chǎng)即時(shí)檢驗(yàn)的需求,但國(guó)內(nèi)尚屬空白,因此,我們期待我國(guó)科研人員加強(qiáng)產(chǎn)業(yè)化意識(shí),積極革新技術(shù),自主開(kāi)發(fā)一款適于我國(guó)DNA快速檢驗(yàn)的低成本、高通量、便攜式的現(xiàn)場(chǎng)快速檢測(cè)儀器,以提升在全集成式DNA快速檢驗(yàn)的國(guó)際競(jìng)爭(zhēng)力。
標(biāo)簽:   微流控技術(shù) 微流控芯片