什么是微流控PCR芯片
基因(遺傳因子)是產(chǎn)生一條多肽鏈或功能RNA所需的全部核苷酸序列?;蛑С种幕緲?gòu)造和性能。儲存著生命的種族、血型、孕育、生長、凋亡等過程的全部信息。PCR技術(shù)是基因研究的重要手段之一,但傳統(tǒng)PCR技術(shù)存在反應(yīng)時間長、能量消耗大、不便于集成與攜帶等缺陷,微流控技術(shù)與PCR結(jié)合可以有效縮小反應(yīng)體系,提高反應(yīng)效率,且易于集成化與微型化。
本文采用【圖解】的方式,講解微流控PCR芯片的分類,原理以及應(yīng)用。幫助大家了解認(rèn)識微流控PCR芯片技術(shù),并在各自研究領(lǐng)域應(yīng)用微流控PCR技術(shù)。
什么是PCR
聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(英文:Polymerase chain reaction,縮寫:PCR),是一種分子生物學(xué)技術(shù),用于擴增特定的DNA片段,這種方法可在生物體外進行,不必依賴大腸桿菌或酵母菌等生物體。PCR過程包括3個步驟: 變性、退火、延伸,需要在高低中3個不同的溫度(高溫變性:90℃~95℃,低溫退火:55℃~60℃;中溫延伸:70℃~72℃)下進行。
微流控PCR芯片
Kopp設(shè)計的世界上第一款微流控PCR裝置
微流控PCR芯片,是基于微流控技術(shù)的PCR反應(yīng)裝置。微流控裝置體積小巧,樣本需求小,成本低,利于現(xiàn)場實時檢測;并且具有小的熱質(zhì),低的熱慣性和快速的熱傳遞,以及巨大的比表面積,可以顯著提高擴增速度。同時,具有高度集成性,全封閉性,可以減少手工操作,有效避免樣本污染。
微流控PCR芯片分類
空間型:流體在微通道運動,溫度區(qū)域固定
時間型:流體在微通道不動,通道內(nèi)溫度變化
LAMP芯片: 恒溫擴增,擴增過程無需溫度變化
數(shù)字PCR:核酸分子絕對定量技術(shù)。將樣品稀釋到單分子水平,并平均分配到幾十至幾萬個單元中進行反應(yīng),在擴增結(jié)束后對每個反應(yīng)單元的熒光信號進行采集,最后通過直接計數(shù)或泊松分布公式計算得到樣品的原始濃度或含量。
微流控PCR空間型-蛇形式
采用三塊銅片作為加熱器的蛇形微流控PCR芯片
微流控PCR空間型-輻射式
一種由太陽能驅(qū)動的便攜式PCR裝置,采用輻射式圓盤作為PCR芯片,圓盤的徑向三個區(qū)域溫度不同。擴增數(shù)據(jù)無線傳輸?shù)狡桨咫娔X進行分析。
微流控PCR空間型-螺旋式
Park 等將一條長3.5m的彈性石英管在有3個溫區(qū)的圓柱加熱器上螺旋式纏繞33周,實現(xiàn)了PCR擴增。其中a為變性區(qū),b為退火區(qū),c為延伸區(qū),d為絕熱區(qū)。
微流控PCR空間型-振蕩式
微流體通道內(nèi)的振蕩液滴示意圖。樣品液滴在三個不同的加熱器之間振蕩移動,用于變性(a),退火(b)和延伸(c),第二個PCR循環(huán)(d-f)
微流控PCR空間型-閉環(huán)式
Sun 團隊將多個閉環(huán)通道合并在一塊芯片內(nèi),利用中心的磁鐵同時對四重閉環(huán)內(nèi)的磁性流體進行操縱,磁性流體繼而推動反應(yīng)液在環(huán)內(nèi)流動,循環(huán)通過 3 個溫區(qū)。
微流控PCR時間型-集成式
Manage等制作的集成式微流控PCR芯片,可以對全血樣本檢測處理。與PCR腔室相鄰的是微流控閥,可以泵送流體。擴增完成后,該裝置可以使用毛細(xì)管電泳分離PCR產(chǎn)物。
微流控PCR時間型-離心式
左圖為存儲試劑的微流控盤片(GeneSlice)和右圖兼容轉(zhuǎn)子架(Rotor),可以容納四個微流控盤片運行。GeneSlice包括樣品預(yù)擴增室,用于轉(zhuǎn)移預(yù)擴增產(chǎn)物的毛細(xì)管虹吸閥,用于樣品等分結(jié)構(gòu)室,等分結(jié)構(gòu)將多余的液體引導(dǎo)到廢物室,用于壓力均衡的通氣孔膜覆蓋。所有需要的試劑都以凍干或風(fēng)干形式預(yù)先儲存。
微流控LAMP芯片
Fang等采用PDMS和玻璃制成的微流控LAMP芯片,用于多種基因分析。該芯片由10個微腔體,以及相互連接的微通道構(gòu)成。
微流控數(shù)字PCR芯片
Song等設(shè)計的具有蛇形通道的數(shù)字PCR芯片,該芯片包括反應(yīng)室和分支通道。a,第一步樣品(紅色染料)流過真空的PDMS裝置;b,反應(yīng)室充滿樣品;c,試用油流過微通道;d,將樣品分成單個體積。形成的獨立的腔室,經(jīng)過擴增后,通過數(shù)字處理方式,對擴增結(jié)果進行分析。
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